番茄紅素缺乏症屬於罕有，而且大多數預防癌症的醫學研究，都針對番茄或番茄類製品進行，而不是番茄紅素補充劑，因此一般人都不需要額外補充。不過，長期肚瀉、腸發炎或有膽囊疾病之人士，較難吸取足夠的番茄紅素，容易產生缺乏症，故需要額外補充。

此外，胃部切除或胰臟消化酵素缺乏者，較易引起脂肪吸收不良（fat malabsorption），其體內的番茄紅素含量會下降，因此攝取量亦需要有所增加。