2016中國足協盃賽抽籤儀式周四在北京舉行，四支亞冠球隊上海上港、廣州恒大、山東魯能、江蘇蘇寧分別落入A、B、C、D四區。其中A、B兩區為上半區，C、D兩區為下半區。今年的八強賽將由一場定勝負改為主客場。 今年的足協盃共有64支球隊參加，分別從中超、中甲、中乙、業餘四個類別中產生。其中中超球隊16支、中甲球隊16支，共32支球隊自動獲得2016中國足協盃賽參賽資格。2016年中乙聯賽參賽俱樂部隊和已獲得2016中國足協盃賽參賽資格的業餘俱樂部隊共32支隊伍，其中2015年中乙參賽隊伍16支，2015年全國業餘聯賽總決賽前八名隊伍8支，2016年足協盃資格賽(各地方足協的盃賽冠軍參加)前八名隊伍8支。 在三輪抽籤後，64支隊伍的座次抽定，四支參加亞冠的球隊分別落入四個賽區。上半區，恒大在十六強賽可能會對陣天津泰達，八強賽則可能遭遇國安或杭州綠城；上港在十六強賽的潛在對手是廣州富力，八強賽可能遭遇石家莊永昌或河北華夏幸福，而永昌和華夏有望在十六強賽上演河北打比。 下半區，魯能在十六強賽將可能迎戰上海綠地申花，八強賽可能遭遇重慶力帆或遼寧宏運；江蘇蘇寧的十六強賽潛在對手是長春亞泰，八強賽可能遇到河南建業或延邊富德。 值得一提的是，從今年開始，足協盃賽程將有改動，即八強賽由一場定勝負改為主客場，這樣足協盃具有看點的比賽將再增加4場。 足協盃歷來是弱隊爆冷溫牀，去年足協盃中甲球隊北京北控就打進了四強。足協盃從2014年起開始設立黑馬獎，武漢宏興奪得當年的首座黑馬獎獎盃，新疆達坂城納歡隊則榮膺2015年該獎項。今年足協盃將繼續設立黑馬獎，將由挑戰高級別或高排名球隊成績最好的一支參賽隊獲得。
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